Pada tahun 2009, pelaksanaan program pemberian beasiswa untuk mahasiswa korban tsunami Aceh kembali dilanjutkan. Program ini direncanakan selesai pada bulan Juni 2009. Karena tahun ini merupakan periode terakhir, maka pelaksanaan program difokuskan kepada proses kelulusan para mahasiswa serta penyusunan dokumentasi.
Pada awal tahun, SEFA sebagai pelaksana program di Aceh merekrut seorang staf bernama Suryani. Suryani menggantikan staff lama, yaitu Iwan Mawardi yang mendapatkan beasiswa untuk menuntut ilmu di
Karena pergantian staff, maka dibutuhkan waktu untuk memberikan pelatihan kepada staff tersebut untuk mempelajari sistem yang digunakan dalam program ini. Hal ini menyebabkan pengiriman beasiswa pada bulan Januari 2009 tidak dapat dilaksanakan, karena PKR KWI belum menerima laporan dari Aceh. Pengiriman baru dilakukan kembali pada bulan Februari 2009.
PAda bulan Februari dan seterusnya, ringkasan pelaksanaan beasiswa selama tahun 2009 adalah sebagai berikut:
Bulan Februari 2009 : Pada tanggal 22 Feb 2009, PKR KWI menerima kiriman dari APTIK sbesar Rp. 330.000.000. Dana ini kemudian dipergunakan untuk memberikan beasiswa bulan Desember 2008 kepada 92 mahasiswa @ Rp. 1.000.000 pada tanggal 24 Februari 2009. Pada bulan ini, ada dua orang mahasiswa yang telah menyelesaikan studinya, yaitu Herawati (Fakultas Pertanian Universitas Syiah Kuala) serta Maisarah (Politeknik Kesehatan Depkes). Sementara itu, terdapat satu orang mahasiswa baru, yaitu Riski HAfnida dari Fakultas Ekonomi Universitas Syiah Kuala.
Bulan Maret 2009 : Pada tanggal 24 Maret 2009, dilakukan pengiriman beasiswa bulan Januari 2009 untuk 88 orang mahasiswa @ Rp. 1.000.000. Pada bulan ini terdapat empat orang mahasiswa yang lulus, yaitu: Herry Juanda (Fakultas Teknik Syiah Kuala), Ridwan Ibrahim (FKIP Serambi Mekkah), Arifzan (Fakultas Pertanian Syiah Kuala), dan M Syahril (Fakultas Teknik Syiah Kuala)
Bulan April 2009 : Pengiriman beasiswa untuk bulan Februari 2009 dilakukan pada tanggal 29 April 2009. Jumlah mahasiswa yang menerima beasiswa pada bulan ini adalah 88 orang @ Rp. 1.000.000. Pada bulan ini tidak ada mahasiswa yang menyelesaikan kuliahnya.
Bulan Mei 2009 : Bulan ini tidak ada pengiriman beasiswa, karena persiapan administratif yang belum lengkap.
Bulan Juni 2009: Karena dana beasiswa belum juga tersedia, sementara para mahasiswa penerima beasiswa sangat membutuhkannya, maka pada bulan Juni 2009 PKR KWI memutuskan untuk memberikan dana pinjaman (talangan) untuk program ini. Akhirnya, beasiswa untuk bulan Maret 2009 dikirimkan pada tanggal 16 Juni 2009. Pada bulan ini, jumlah mahasiswa yang menerima beasiswa adalah 87 orang, dan ada satu mahasiswa yang telah menyelesaikan kuliahnya, yaitu Erlinawati, mahasiswa Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP) Universitas Serambi Mekkah.